MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	CTT	2	6	1	6	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017456	CTA	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017456	CA	3	6	43	48	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017456	A	7	7	61	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017456	GTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017456	GCC	2	6	153	158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385800987
7	NC_017456	AAC	2	6	260	265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800987
8	NC_017456	TCTGC	2	10	324	333	0 %	40 %	20 %	40 %	385800987
9	NC_017456	CTT	2	6	337	342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800987
10	NC_017456	GTAA	2	8	429	436	50 %	25 %	25 %	0 %	385800987
11	NC_017456	ATA	2	6	463	468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800987
12	NC_017456	ATA	2	6	475	480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800987
13	NC_017456	TTC	2	6	506	511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800987
14	NC_017456	A	6	6	519	524	100 %	0 %	0 %	0 %	385800987
15	NC_017456	T	6	6	533	538	0 %	100 %	0 %	0 %	385800987
16	NC_017456	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800987
17	NC_017456	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800987
18	NC_017456	AT	3	6	893	898	50 %	50 %	0 %	0 %	385800987
19	NC_017456	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800987
20	NC_017456	CTA	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800987
21	NC_017456	GAT	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800987
22	NC_017456	GGT	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800987
23	NC_017456	AAG	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800987
24	NC_017456	TAA	2	6	1091	1096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800987
25	NC_017456	ATG	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800987
26	NC_017456	CGG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385800987
27	NC_017456	AACC	2	8	1362	1369	50 %	0 %	0 %	50 %	385800987
28	NC_017456	T	6	6	1407	1412	0 %	100 %	0 %	0 %	385800987
29	NC_017456	ATC	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800987
30	NC_017456	TGA	2	6	1481	1486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800987
31	NC_017456	TGG	2	6	1595	1600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800987
32	NC_017456	ATGC	2	8	1620	1627	25 %	25 %	25 %	25 %	385800987
33	NC_017456	A	6	6	1719	1724	100 %	0 %	0 %	0 %	385800987
34	NC_017456	GTTT	2	8	1751	1758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017456	TAAA	2	8	1766	1773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017456	TAGT	2	8	1784	1791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017456	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017456	TAA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017456	TGT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017456	AAC	2	6	2011	2016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017456	TTA	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017456	TATTT	2	10	2032	2041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017456	TTAC	2	8	2063	2070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017456	AACT	2	8	2073	2080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017456	GCA	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017456	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800988
47	NC_017456	TTC	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800988
48	NC_017456	CT	3	6	2303	2308	0 %	50 %	0 %	50 %	385800988
49	NC_017456	CAT	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800988
50	NC_017456	A	6	6	2403	2408	100 %	0 %	0 %	0 %	385800988
51	NC_017456	ACT	2	6	2429	2434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800988
52	NC_017456	TCT	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800988
53	NC_017456	AGT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800988
54	NC_017456	AGA	3	9	2587	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800988
55	NC_017456	GAT	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800988
56	NC_017456	ACAG	2	8	2657	2664	50 %	0 %	25 %	25 %	385800988
57	NC_017456	AGTA	2	8	2845	2852	50 %	25 %	25 %	0 %	385800988
58	NC_017456	TGA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800988
59	NC_017456	ATT	2	6	2924	2929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800988
60	NC_017456	TTA	2	6	2943	2948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800988
61	NC_017456	TTG	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800988
62	NC_017456	ATT	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800988
63	NC_017456	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800988
64	NC_017456	TTG	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800988
65	NC_017456	ATAA	2	8	3274	3281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017456	ATGT	2	8	3282	3289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017456	AGT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017456	TTG	2	6	3397	3402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017456	ATC	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017456	ATA	2	6	3514	3519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017456	TTTC	2	8	3637	3644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017456	T	6	6	3667	3672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017456	ATT	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017456	AAC	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017456	TCT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017456	TCTA	2	8	3794	3801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017456	ATA	2	6	3802	3807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017456	CAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017456	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017456	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017456	A	8	8	3905	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017456	TAA	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017456	TAG	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017456	TCT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017456	AGA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017456	GAT	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017456	TAA	2	6	4141	4146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017456	ATC	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017456	TTTA	2	8	4217	4224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017456	AGA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017456	A	6	6	4237	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017456	GAT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017456	T	6	6	4275	4280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017456	AGA	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017456	AGAACA	2	12	4327	4338	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017456	TTA	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017456	AGA	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017456	AT	3	6	4410	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017456	TAG	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017456	A	7	7	4428	4434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017456	TAA	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017456	TAA	3	9	4459	4467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017456	CTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017456	ATT	2	6	4502	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017456	AAT	2	6	4508	4513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017456	A	6	6	4516	4521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017456	AAT	2	6	4532	4537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017456	AAT	2	6	4556	4561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800989
109	NC_017456	TAAA	2	8	4573	4580	75 %	25 %	0 %	0 %	385800989
110	NC_017456	TTA	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800989
111	NC_017456	T	6	6	4618	4623	0 %	100 %	0 %	0 %	385800989
112	NC_017456	A	6	6	4633	4638	100 %	0 %	0 %	0 %	385800989
113	NC_017456	GAAAA	2	10	4644	4653	80 %	0 %	20 %	0 %	385800989
114	NC_017456	TAA	2	6	4748	4753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800989
115	NC_017456	A	6	6	4752	4757	100 %	0 %	0 %	0 %	385800989
116	NC_017456	TGG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800989
117	NC_017456	TA	3	6	4839	4844	50 %	50 %	0 %	0 %	385800989
118	NC_017456	A	7	7	4932	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	385800989
119	NC_017456	A	6	6	4952	4957	100 %	0 %	0 %	0 %	385800989
120	NC_017456	TATTAA	2	12	4958	4969	50 %	50 %	0 %	0 %	385800989
121	NC_017456	A	6	6	4999	5004	100 %	0 %	0 %	0 %	385800989
122	NC_017456	A	6	6	5010	5015	100 %	0 %	0 %	0 %	385800989
123	NC_017456	AATA	2	8	5018	5025	75 %	25 %	0 %	0 %	385800989
124	NC_017456	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800989
125	NC_017456	TAA	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017456	T	6	6	5128	5133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017456	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
128	NC_017456	TGA	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
129	NC_017456	ATG	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
130	NC_017456	ACC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385800990
131	NC_017456	TGA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
132	NC_017456	GAT	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
133	NC_017456	TGG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800990
134	NC_017456	GGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385800990
135	NC_017456	TGG	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800990
136	NC_017456	GTT	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800990
137	NC_017456	TCG	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800990
138	NC_017456	GAA	2	6	5760	5765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
139	NC_017456	AAC	2	6	5819	5824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800990
140	NC_017456	CAG	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800990
141	NC_017456	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
142	NC_017456	GAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
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495	NC_017456	TAT	2	6	20939	20944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_017456	AAAC	2	8	21012	21019	75 %	0 %	0 %	25 %	385801002
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498	NC_017456	GAA	2	6	21090	21095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801002
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